Иако неуједначеним темпом, фонд Библиотеке непрестано се увећавао куповином, разменом и поклонима. Библиотека данас има 21554 наслова књига, 1183 наслова часописа (76830 бројева), 1005 географских и геолошких карата и 226 рукописа. Од укупног броја наслова часописа на српском, односно српскохрватском језику је 261. У фонду Библиотеке највреднији је велики број старих и ретких књига, прва издања, и комплети многобројних значајних научних часописа из целог Света.
У Библиотеци се налазе и комплети часописа Гласник Природњачког музеја у Београду (сер. А, Б и Ц, до 1966.: Гласник Музеја шумарства и лова), као и сва посебна издања Музеја. У гласницима Природњачког музеја објављена су 1154 рада. Штампани су углавном на српском језику са резимеима на неком од светских језика од којих је највише заступљен енглески. Већина Посебних издања штампана је такође на српском језику.
Свој часопис, Гласник Природњачког музеја у Београду, Библиотека размењује са сродним установама у земљии иностранству.
Богатство и разноврсност Библиотеке у потпуности могу да одговоре потребама научног и стручног рада у свим областима геолошких и биолошких наука.